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子宮内膜とは子宮の内腔を壁紙のようにおおっている粘膜で、女性ホルモンの影響を受けて毎月増殖しますが、妊娠しないと月経として剥がれて排出されます。
原因はわかっていませんが、この子宮内膜と同様の組織が子宮の内腔以外の場所（子宮の壁の中、子宮周辺の腹膜、卵巣など）で増殖することがあります。
これ が子宮内膜症で、この内膜症組織も女性ホルモンの作用で増殖と出血を繰り返すため、炎症が起こり周辺組織との癒着をおこします。

一番多いのは月経痛で、子宮内膜症の90％にみられます。
月経時以外にも下腹部痛や腰痛を起こすことも多く、子宮周辺の癒着がひどくなると性交痛や排便痛がおこります。
また、子宮内膜症をもつ人の30～40％が不妊症であるとされています。
内膜症組織が卵巣にできると毎月の出血がたまり、溶けたチョコレートのような古い血液でふくらんだチョコレート嚢腫とよばれる卵巣腫瘍になります。

本来は手術や腹腔鏡検査（内視鏡でおなかのなかを観察する検査）にて腹腔内に内膜症組織がないかどうかを調べることが必要ですが、実際には内診と超音波検査、CA 125という内膜組織が作る物質を採血で調べるなどして、総合的に診断を付けます。